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《Nature》:冷凍電鏡蛋白解析再獲突破!

最近,美國科學家利用冷凍電鏡技術揭開ATP-檸檬酸裂解酶(ACLY)的神秘面紗,其或成為癌癥治療的下一個主要分子靶點。


ATP-檸檬酸裂解酶(ACLY)是一種中心代謝酶,催化ATP依賴性檸檬酸和輔酶A(CoA)轉化為草酰乙酸和乙酰-CoA1-5。哥倫比亞大學的科學家們與Nimbus Therapeutics的研究人員合作,利用冷凍電鏡技術揭開了這種代謝酶的神秘面紗,這種酶可能成為癌癥治療的下一個主要分子靶點,這項研究的最新進展發表于《Nature》雜志。


首先,我們來了解下究竟什么是ACLY。ATP-檸檬酸裂解酶(ACLY)是一種中心代謝酶,催化ATP依賴性檸檬酸和輔酶A(CoA)轉化為草酰乙酸和乙酰-CoA。乙酰輔酶A對脂肪酸的代謝、膽固醇的生物合成以及蛋白質的乙酰化和異戊烯化至關重要。作為抗癌藥物的靶標,ACLY一直備受關注,因為許多癌細胞依賴它進行腫瘤的轉移與擴散。ACLY也是抗血脂異常和肝脂肪變性的靶向位點,部分藥物目前正在進行3期臨床試驗。當前已報道許多ACLY抑制劑,但其中大多數僅具有很弱的活性。


雖然之前的實驗已經成功完成了該酶的片段,但此次哥倫比亞大學Liang Tong及其研究團隊的工作揭示了在高分辨率下人類ACLY的完整結構。Liang Tong教授表示,“ACLY是一種控制細胞內許多過程的代謝酶,包括癌細胞中的脂肪酸合成。通過抑制這種酶,我們可以控制癌癥的生長。此外,該酶還具有包括包括調節膽固醇生物合成等其他作用,因此針對該酶的抑制劑也可用于控制膽固醇水平。同時,靶向治療是癌癥研究的一個熱點領域,癌細胞中的某些特定分子會幫助它們生長,分裂和傳播,而此次解析的ACLY酶也是其關鍵的一員。通過阻斷這些分子的作用,我們可以有效的抑制腫瘤生長與擴增。”



今年早些時候,另一組研究人員展示了一項針對高膽固醇治療的口服療法bempedoic acid的3期臨床試驗結果。該藥物是第一代ACLY抑制劑,單獨服用可降低低密度脂蛋白(LDL)膽固醇30%,與他汀類藥物聯合使用可降低20%。


目前已經發現ACLY在幾種類型的癌癥中過表達,并且實驗已經證實“關閉”ACLY可引起癌細胞停止生長和分裂。了解ACLY的復雜分子結構將使研究者了解到該分子最佳的抑制區域,為靶向藥物開發鋪平道路。


Liang Tong及其研究團隊使用紐約結構生物學中心的設施,使用冷凍電鏡技術(Cryo-EM)來解析ACLY的復雜結構。Cryo-EM允許使用電子顯微鏡對冷凍生物樣本進行高分辨率成像。然后將一系列二維圖像計算重建為精確、詳細的復雜生物結構(如蛋白質,病毒和細胞)的三維模型。


冷凍電鏡結果揭示了有效抑制ACLY的意外機制。研究小組發現,抑制劑結合需要酶結構的顯著變化。然后,這種結構變化間接阻斷底物與ACLY的結合,從而防止酶活性發生。這種新的ACLY抑制機制可以為開發治療癌癥和代謝紊亂的藥物提供更好的方法。


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